Metobolik cerrahi ameliyatları sindirim sistemine yapılan diğer cerrahi operasyonlardan farklı riske sahip bir operasyon değildir. Erken dönemde kanamalar, Enfeksiyonlar, Geç dönemde ise internal fıtık dediğimiz bağırsakların iç içe girmesi olarak karşımıza çıkabilir. Ama hastaların korkacağı büyük bir risk yoktur.